Kościół zbudowany jest na planie krzyża łacińskiego, jego dłuższe ramię leży na linii wschód-zachód. Wejście do kościoła znajduje się po stronie wschodniej, naprzeciwko wejścia znajduje się prezbiterium. Krótsze ramię krzyża leży na linii północ-południe; w jego południowej części znajduje się zakrystia.

Wnętrze świątyni ma charakter barokowy; kościół posiada trzy nawy. W nawie północnej znajduje się ołtarz Chrystusa Ukrzyżowanego, umieszczono w nim skałę z Góry Oliwnej. W nawie południowej znajduje się ołtarz Matki Bożej Częstochowskiej z umieszczoną w nim skałą z Nazaretu. W prezbiterium znajduje się drewniany ołtarz główny. Pierwsza świątynia w tym miejscu powstała w połowie XVIII w. Dzisiejszy kościół został wybudowany w latach 1790-1793 dzięki inicjatywie ks. Jana Zieniewicza jako cerkiew greckokatolicka. Konsekracja miała miejsce 28 maja 1798 r. Po likwidacji unickiej diecezji chełmskiej świątynia została zamieniona na cerkiew prawosławną. W 1916 r. Biłgoraj opuścił ostatni proboszcz prawosławny (bieżeństwo) i cerkiew została zamknięta. W 1919 r. świątynia została przekazana katolikom obrządku łacińskiego jako kościół rektoralny w parafii Wniebowzięcia NMP w Biłgoraju. W tym samym roku został przeprowadzony remont, w wyniku którego zatarte zostały stylowe cechy obiektu.

11 września 1939 kościół niemal cudem uniknął zniszczenia podczas wielkiego pożaru miasta. Nie został uszkodzony również podczas bombardowań 8 i 14 września. Natomiast całkowicie został zniszczony kościół parafialny, czego skutkiem było odprawianie tutaj wszystkich nabożeństw do 1940. W 1942 świątynię ponownie przejęli prawosławni, jednakże po zakończeniu wojny kościół znów znalazł się w rękach katolików obrządku łacińskiego. W 1978 r. przeprowadzono renowację świątyni, podczas której odkryto fragmenty polichromii z XIX w. 3 czerwca 1984 świątynia przestała być kościołem rektoralnym, a stała się siedzibą parafii św. Jerzego w dekanacie Biłgoraj Północny. Pierwszym proboszczem został dotychczasowy rektor ks. Marian Goral. W 2004 ks. Czesław Szuran, proboszcz parafii sprowadził relikwie św. Faustyny Kowalskiej, a w latach 2006-2007 odbył się gruntowny remont bocznych naw. W 2009 parafia przeżywała 25lecie swojego istnienia, z tej okazji ówczesny proboszcz sprowadził relikwie św. Andrzeja Boboli, rozpoczęto też budowę podziemnej kaplicy na cześć tego świętego. Za wiki