Pierwsza wzmianka o miejscowości pochodzi z 1273 r. W średniowieczu Krzyżowice należały do rodu Pogorzelów (Pogrell) posiadającego znaczne dobra w okolicach Niemodlina i Grodkowa. Następnie właścicielami miejscowości byli Kittlitzowie, między innymi wzmiankowany w 1587 r. Jerzy von Kittlitz. W XVII w. majątek w Krzyżowicach posiadała rodzina von Gregersdorf. W XIX w. dobra należały do rodziny von Richthofen. W 1860 r. Fryderyk Gotard Ewald (1827-1889), drugi syn Adama Fryderyka Gustawa von Pfeil z Janowa kupił od N. barona von Richthofena majątek w Krzyżowicach. Jego małżonka, Maria z domu Brandt von Lindau (1837-1922), w 1893 r. przekształciła dobra w fideikomis. Właścicielem majoratu został ich najstarszy syn Jan Fryderyk Gustaw Ginter (1863-1939). Wspominają go jako Grafa Günthera von Pfeil und Klein-Ellguth księgi adresowe z lat 1905-1930. Wynika z nich, że posiadłość powoli ulegała zmniejszeniu, w 1905 r. liczyła 405 ha, w 1930 r. – 396 ha. Według książki adresowej z 1937 r. majątek o powierzchni tylko 330 ha należał już do Grafa Walter von Pfeil und Klein-Ellguth. W rękach tej rodziny posiadłość pozostała do końca drugiej wojny światowej, następnie została znacjonalizowana. Rezydencję Pfeilów po 1945 r. przekształcono w wielorodzinny budynek mieszkalny. Obecnie w dalszym ciągu pełni te funkcje, dlatego też można ją zobaczyć tylko z zewnątrz.