Kościół farny w Biskupcu istniał już w czasie lokacji miasta przez biskupa warmińskiego Henryka Sorboma 17 października 1395. Pierwotnie była to świątynia halowa o wielkości obecnej nawy głównej.



W czasie wojny głodowej w roku 1414 kościół został spalony. Biskup Łukasz Watzenrode przeznaczył na jego odbudowę materiały z rozbiórki kościoła św. Ducha w Lidzbarku. Brak jest szczegółowych informacji, ale odbudowany kościół uległ zniszczeniu w czasie wojny polsko-krzyżackiej 1519-21. Nowy kościół konsekrował 26 kwietnia 1580 roku biskup Marcin Kromer. Wówczas w wieży kościelnej ulokowano szkołę.



Drewniana wieża kościoła spłonęła 13 maja 1651 r. , a odbudowano ją w 1668. Wieża ponownie spłonęła 26 lutego 1700 , a odbudowano ją w roku 1717. W latach 1728-1734 odbudowywano ponownie kościół. Kościół został powiększony :przedłużono prezbiterium i dodano ołtarze boczne Przemienienia Pańskiego i św. Walentego. Kościół ten był wielkości obecnej nawy środkowej. Kościół był konsekrowany przez biskupa sufragana Łaszewskiego 14 sierpnia 1735.



Kościół ponownie spłonął 21 kwietnia 1766 wraz z wieżą i plebanią. Kościół odbudowano kilkanaście lat później ze składek z całej diecezji warmińskiej przy wsparciu biskupa Ignacego Krasickiego. Szczególną ofiarność wykazał właściciel Stanclewa Zygmunt Zeyguth Stanisławski, który opłacił budowę wieży kościelnej 1783 i zafundował organy gdańskie (przetrwały do 1922).



Kościół w roku 1838 przechodził konserwację. Kościół okazał się za mały dla zwiększającej się liczby parafian. Rozbudowę kościoła w roku 1881 rozpoczął ówczesny proboszcz biskupiecki ks. Edward Herrmann . Dobudowano dwie boczne nawy z kaplicami i poszerzono chór. Kościół był konsekrowany już przez biskupa Edwarda Herrmanna 6 lipca 1908



Kościół został spalony w czasie II wojny światowej, a odbudowano go w latach 1948-1949.



Z dawnego wyposażenia kościoła zachowała się wieczna lampka z 1740 r. i misa chrzcielna z XVI w. W dobrym stanie dotrwał do naszych czasów fragment barokowego ogrodzenia z XVIII wieku.



Info za [