Cerkiew orientowana, dwudzielna o prezbiterium zamkniętym półkoliście.
Obecna, murowana cerkiew stoi prawdopodobnie w miejscu poprzedniej, drewnianej świątyni unickiej która spłonęła w 1784 r.
Budowę cerkwi greckokatolickiej rozpoczęto w 1829 roku z inicjatywy ówczesnego właściciela Baligrodu - Onufrego Karsznickiego . Do budowy użyto kamieni, przypuszcza się, że jako spoiwo posłużył piasek mieszany z jajami kurzymi i krwią wołów.
W 1928 r. cerkiew wyremontowano i przebudowano, w wyniku czego zakończoną baniastym hełmem sygnaturkę zastąpiono drewnianą kopułą.
W trakcie akcji "Wisła", w 1947 r. wyposażenie cerkwi zostało wywiezione przez oddział KBW a następnie cerkiew wykorzystywano jako magazyn, co przyczyniło się do postępującej dewastacji budynku.
Pierwsze próby ratowania świątyni nastąpiły w 1990 r., jednak remont szybko przerwano ze względu na brak funduszy. W roku 2001 przegnicie konstrukcji kopuły spowodowało stopniowe zapadanie się jej konstrukcji do wnętrza.
W roku 2003 ks. Miron Michajłyszyn, greckokatolicki kapelan Wojska Polskiego, wysunął pomysł urządzenia w baligrodzkiej cerkwi świątyni greckokatolickiego ordynariatu polowego jednak władze gminy nie miały funduszy ani na zabezpieczenie, a tym bardziej na odbudowę zabytku.
Latem 2004 powstało Stowarzyszenie Ratowania Cerkwi w Baligrodzie, które za swój cel postawiło sobie odbudowę zruinowanego zabytku. Rok później Gmina Baligród przekazała cerkiew na własność Stowarzyszenia. Od 2006 r. trwają prace remontowe. Więcej i nformacji: