Kościół w Świerklach został wybudowany w 1949 roku dzięki staraniom ks. Henryka Mainki, proboszcza Czarnowąsów - parafii, do której Świerkle należały. Poświęcenia nowej świątyni dokonał 22 sierpnia 1949 roku ks. Plotnik z Siołkowic. Tuż po tym akcie Świerkle zostały włączone do parafii w Brynicy, w której obrębie funkcjonowały do końca stycznia 1957 roku. W 1957 roku ponownie znalazły się w granicach parafii Czarnowąsy.
W czerwcu 1970 roku w pożarze kościoła ucierpiała zakrystia, dach, uszkodzone zostały organy, spłonęły szaty liturgiczne. Po trwającym ponad dwa miesiące remoncie przywrócono kościołowi dawną świetność. W 1974 roku z okazji jubileuszu 25-lecia kościoła ufundowano dwa dzwony - jeden pod wezwaniem św. Józefa, drugi pod wezwaniem św. Jana Chrzciciela. Powiększono wówczas zakrystię oraz otwarto w tylnej części kościoła taras pełniący rolę ołtarza polowego i sceny. W 1981 roku przeprowadzono generalny remont kościółka.