Obecny kościół św. Andrzeja Boboli w Krotoszynie, jest dawnym zborem ewangelickim św. Trójcy zbudowanym w latach 1788 – 1790. Budowniczowie, potomkowie niemieckich osadników, religijnych uciekinierów, budowlę swej świątyni wzorowali na warszawskim kościele luterańskim św. Trójcy – pierwotnie była to budowla w kształcie walca, w stylu neoklasycystycznym, na rzucie koła. W latach 1884-1885 dobudowano neobarokową fasadę z dwoma wieżami. Do dziś zachowały się oryginalne organy z 1884 roku i charakterystyczny dla kościołów ewangelickich wystrój wnętrza. Obiektowi towarzyszyły pastorówka i dom kantora z 1846, a także cmentarz ewangelicki (przy ul. Rawickiej, dziś zniszczony). W 1945 roku kościół przejęli katolicy i nadali mu wezwanie św. Andrzeja Boboli.