Zbór ewangelicki został zbudowany przez fabrykancką rodzinę Moesów na potrzeby niemieckich pracowników fabryki włókienniczej w Choroszczy. Pierwsza świątynia była zbudowana z drewna. W 1912 roku drewnianą kirchę poddano rozbiórce, a w jej miejsce wzniesiono nowy murowany budynek z nieotynkowanej cegły w stylu neoromańskim z elementami neogotyckimi (pinakle, skarpy, zwieńczenie wieży). Zbór św. Zygmunta w Choroszczy był filią parafii ewangelicko – augsburskiej pod wezwaniem św. Jana w Białymstoku.

W latach 1930 – 1939 oraz w latach 1944 - 1947 budynek świątyni wykorzystywany był na potrzeby kościoła rzymsko-katolickiego jako kościół szpitalny. W 1944 roku została zniszczona górna część wieży. W latach 1962 – 1963 kircha została rozebrana. Obecnie na placu Brodowicza stoi krzyż upamiętniający dawną świątynię ewangelicką.