Muzeum Sztuki Współczesnej mieści się w klasycystycznym budynku dawnej komendantury garnizonu twierdzy szczecińskiej, wybudowanym w 4. ćwierci XVIII wieku, w późniejszych latach wielokrotnie przekształcanym. Aż do końca II wojny światowej służył on władzom wojskowym. W latach 70. XX wieku został przekazany Muzeum Narodowemu w Szczecinie. W 1980, po adaptacji, stał się siedzibą oddziału sztuki współczesnej, który poprzez cykle wystaw czasowych realizuje program upowszechniania i promocji sztuki współczesnej w oparciu o kolekcję własną (sztuka polska i obca) oraz projekty opracowywane we współpracy z innymi instytucjami, organizacjami i artystami w kraju i za granicą.