Na mocy przywileju wystawionego w Elblągu 16 VI 1454 r., król Kazimierz Jagiellończyk podarował Gdańskowi teren Szafarni (obejmującej wtedy także Ołowiankę), nakazując, by wybudowano „dobry spichlerz dla przechowywania naszego zboża”. Spichlerz Królewski otrzymał swą obecną postać w latach 1608–1621, dekoracje kamieniarskie były dziełem Abrahama van den Blocka, część prac budowlanych prowadził Hans Strakowski.

W myśl przywileju spichlerz stał do dyspozycji polskich królów, co nie przeszkadzało gdańszczanom wynajmować jego pomieszczeń prywatnym kontrahentom.

Po zniszczeniach w 1945 r., stary spichlerz został odbudowany przez pracowników sąsiadującej z nim elektrowni (od 1962 r. - elektrociepłowni) i był wykorzystywany do celów magazynowych.

Po likwidacji elektrociepłowni "Ołowianka" budynek został odnowiony i od 2004 r. działa w nim hotel.