Przed II wojną światową wieś zamieszkiwana była przez Rusinów Łemków. Po II wojnie światowej jej mieszkańcy zostali wysiedleni, a zabudowania spalone. Obecnie tereny dawnej wsi Czarna Woda należą administracyjnie do wsi Jaworki, której rdzenni mieszkańcy również zostali wysiedleni, a wieś została następnie zasiedlona powtórnie, głównie przez ludność ze Spisza i Podhala. 1 stycznia 2008 obszar Czarnej Wody został wyłączony spod administracji miasta Szczawnicy (w związku ze zmianą rodzaju gminy z miejskiego na miejsko-wiejski) i przyłączony do nowo powstałej (również wyłączonej ze Szczawnicy) wsi Jaworki, otrzymując ze względu na swoją historyczną wartość status części wsi. pl.wikipedia.org/wiki/Czarna_Woda_(Jaworki)