Kościół świętego Andrzeja Apostoła w Prabutach – rzymskokatolicki kościół filialny znajdujący się w mieście Prabuty, w województwie pomorskim. Należy do dekanatu Prabuty diecezji elbląskiej.



Świątynia została wzniesiona z cegły w latach 1876-1878 dla istniejącej od 1870 roku parafii katolickiej w mieście. Wieża została zbudowana w 1903 roku. Wzniesiono ją na rzucie prostokąta, nakryta jest spiczastym hełmem. Budowla nosiła wcześniej wezwanie świętego Wojciecha, a także Najświętszego Serca Pana Jezusa. Kościół reprezentuje styl neogotycki. Składa się z nawy z zewnętrznymi przyporami oraz wielobocznego prezbiterium. Do wyposażenia świątyni należą zabytkowe organy oraz neogotyckie ołtarze.

Po II wojnie światowej jednym z pierwszych proboszczów w Prabutach był franciszkanin i jasnowidz Czesław Klimuszko, który rozpoczął remont tej świątyni.