Kościół ten jest wiązany z klasztorem dominikanów który mieścił się na dzisiejszym placu Targowym. Nadal w obiegu znajduje się w odniesieniu do tej świątyni określenie „kościół dominikański”. Obecna zakrystia stanowi część krużganku klasztornego. Po sekularyzacji cały klasztor rozebrano latach dwudziestych XIX wieku. Zręby kościoła wskazują na ich XIII-wieczny rodowód. Obecny układ architektoniczny powstał w 1655 roku. W wyniku odbudowy po pożarze z 1637 roku. Data odbudowy oraz herb Odrowążów, z których wywodzą się śląscy dominikanie –św. Jacek i błogosławiony Czesław, widnieją na kamiennej ościeżnicy drzwi prowadzących od północnej strony na chór. W wyniku przeprowadzonej sekularyzacji kościół miał być zniesiony. Podobnie jak uczyniono to z klasztorem. Tak los spotkał kościół św. Piotra i Pawła konwentu bożogrobców w Nowym Mieście orz kościół klasztoru franciszkanów na Bronkach. Dzięki zabiegom proboszcza Jana Nepomucena Zolondka udało się kościół św. Jakuba zachować. Na mocy porozumienia z 1811 roku przeznaczono kościół dominikański dla odprawiania w nim nabożeństw w języku polskim. Pożary nie Ominęły w 1945 roku i tego kościoła. Spalił się dach i ołtarz główny, uszkodzono sklepienie prezbiterium odbudowę rozpoczęto zaraz w 1945 roku a zakończono w roku 1947: żródło: