Cmentarz żydowski (jeden z trzech znajdujących się w Pińczowie) funkcjonował między ulicami Słabską i Spółdzielczą, nazywany był "Nowym cmentarzem" i zajmował obszar ok. 1,50 h². Na początku lat 50. był ogrodzony, ale pozbawiony nagrobków i nieużytkowany. Ostatni znany pochówek odbył się w tym miejscu w 1942 r. Teren cmentarza został poważnie zdewastowany podczas I oraz II wojny światowej. Do czasów współczesnych nie zachował się żaden element kirkutu

Od 1990 r. na terenie otaczającym synagogę umieszcza się fragmenty odzyskiwanych nagrobków (również z tego cmentarza), które zostały rozgrabione przez Niemców i Polaków podczas II wojny światowej. W ten sposób powstaje lapidarium. Najstarsze odczytane inskrypcje nagrobne pochodzą z 1608 r.