W 1355 r. z fundacji książąt dobrzyńskich Bolesława i Władysława wzniesiono w Rypinie kościół pod wezwaniem Świętej Trójcy. Około 1400 r. biskup Jakub z Korzkwi erygował w niej ołtarz Bożego Ciała. Na przełomie XV i XVI wieku dobudowano do świątyni boczną kaplicę z ołtarzem Chrystusa Ukrzyżowanego. W XIX i XX wieku kościół był gruntownie remontowany, m.in. w 1821, 1825, 1840, 1865 i 1905 r.



Z zachowanych w świątyni zabytków sztuki sakralnej na uwagę zasługuje krzyż umieszczony na belce tęczowej pochodzący z XVI wieku, chrzcielnica i ambona z XVIII wieku.