W 1894r. William Henry Mc Garvey ofiarował plac pod budowę szkoły ludowej w Gliniku Mariampolskim. W 1895r. oddano do użytku jednoklasową szkołę. W latach 1926-1929 wybudowany obecną bryłę budynku. W 1973r. wybudowano salę gimnastyczną. W 1991r. nadano patronat św. Jana Kantyny. W 2002r. powstał Miejski Zespół Szkół nr 4, który tworzyły Szkoła Podstawowa nr 3 i Gimnazjum nr 5, w 2006r. zmieniono nazwę na obecną.