Instytut Technologiczno-Przyrodniczy został powołany zarządzeniem nr 76 Ministra Rolnictwa i Rozwoju Wsi z dnia 23 grudnia 2009 r. w sprawie nadania statutu Instytutowi Technologiczno-Przyrodniczemu. Datą powstania jest 1 stycznia 2010 roku. W jego skład weszły struktury Instytutu Budownictwa, Mechanizacji i Elektryfikacji Rolnictwa (IBMER) oraz Instytutu Melioracji i Użytków Zielonych (IMUZ), których historia sięga lat 50. XX w. IBMER dał początek pionowi inżynieryjno-rolniczemu (technologicznemu), a IMUZ agro-środowiskowemu (przyrodniczemu). Siedzibą nowego instytutu stała się siedziba byłego IMUZ-u w pałacu w Falentach (aleja Hrabska 3). Pierwszym dyrektorem został prof. dr hab. inż. Edmund Kaca. W momencie powstawania kadra liczyła prawie 430 osób, z czego ok. stu ze stopniem co najmniej doktora.