Parafia pod wezwaniem Św. Franciszka i Św. Klary przy ul. Paprocańskiej 90 swe początki zawdzięcza decyzji ówczesnego metropolity katowickiego Arcybiskupa Damiana Zimonia o utworzeniu w Tychach ośrodka zakonnego prowincji franciszkańskiej, który miał prowadzić także duszpasterstwo parafialne.
Dekret biskupa katowickiego z 25.08.1995 r. zalecał zorganizowanie parafii na terenie należącego do parafii Św. Marii Magdaleny „Domu Harcerza” oraz działki u zbiegu ulic Paprocańskiej i Przemysłowej, które zostały przekazane pod budowę nowej parafii dnia 18.01.1995 r. przez Radę Miejską w Tychach. Tymczasowa kaplica została przygotowana jeszcze na Pasterkę w roku 1995 i od tego czasu rozpoczęto odprawianie regularnych mszy św. Poświęcenia kaplicy tymczasowej i klasztoru nastąpiło w dniu 23.04.1996 r, a dokonał tego ks. arcybiskup Damian Zimoń. Ustanowienie parafii pod wezwaniem Św. Franciszka i Św. Klary nastąpiło na mocy dekretu arcybiskupa katowickiego z dnia 16.05.1996 r., zaś erygowanie domu zakonnego prowincji franciszkańskiej nastąpiło w dniu 10.12.1998 r. Kamień węgielny pod budowę kościoła został poświęcony przez Ojca Św. Jana Pawła II w czasie jego pielgrzymki do Polski, na spotkaniu z wiernymi ze śląska w Gliwicach. Poświęcenia placu budowy dokonał biskup Stefan Cichy w dniu 4.10.1999 r.
W roku tym po raz pierwszy na terenie placu budowy powstała 'żywa szopka', która jest budowana w okresie bożonarodzeniowym do dnia dzisiejszego.
Do dnia dzisiejszego trwa także budowa kościoła, trwająca już 13 lat.
Proboszczem parafii od 2001 r. jest ojciec Emil Pacławski, któremu w pracy pomaga wikariusz ojciec Remigiusz Langer, zaś w klasztorze przebywa jeszcze 5 innych zakonników.
Obecnie parafia liczy ponad 5200 parafian.