Parafia św. Jana Chrzciciela w Malborku – rzymskokatolicka parafia należy do dekanatu Malbork I w diecezja elbląska. Erygowana w 1276 roku, reerygowana 22 kwietnia 1973 roku przez Biskupa Warmińskiego Józefa Drzazgę.
Pierwszą świątynię zbudowaną poza murami zamku przeznaczoną dla rozwijającej się osady w XIII w. był kościół św. Jana. kościół zburzono w okresie wojny trzynastoletniej, podczas oblężenia miasta 1457-1460. Drugą świątynię rozpoczęto wznosić na starych fundamentach. Prace trwały bardzo długo od 1467-1523 r. W 1668 r. po pożarze bryłę kościoła skrócono o jedno przęsło. W czasie ostatniej wojny kościół św. Jana uległ ponownemu zniszczeniu. Ofiarą padła wieża i jedyny dzwon. Zburzone zostały dachy, a podziurawione sklepienie utraciło swój piękny wygląd. Neogotyckie ołtarze ocalały w całości. W 1945 r. przystąpiono do usuwania gruzów, szklenia okien i zabezpieczenia przed opadami atmosferycznymi. Już 2 maja 1945 r. kościół został wyświęcony przez ks. Konrada Willa, a 3 maja ks. Klemens Majewski odprawił w nim pierwsze nabożeństwo. W 1956 r. ks. biskup Tomasz Wilczyński przekazał kościół św. Jana Zgromadzeniu Księży Orionistów i ustanowił przy kościele św. Jana Chrzciciela samodzielny wikariat.