Parafia głubczyńska została utworzona przez opata cystersów Andrzeja Kościelec-Kościeleckiego (1588 r.) -właściciela dóbr głubczyńskich. Ufundowany kościół był budowlą drewnianą św. Jana Chrzciciela. Fundacja parafii i probostwa została potwierdzona przez arcybiskupa gnieźnieńskiego Stanisława Karnkowskiego. Obecny kościół parafialny zbudowany został w latach 1869-1871 w stylu neogotyckim, przez Bojanowskich. W górnej części ołtarza znajdują się herby Grabowskich i Bojanowskich, ostatnich właścicieli Głubczyna.

W skład zespołu kościoła parafialnego wchodzi:
- kościół p.w. Świętej Trójcy z 1869-71
- dzwonnica, murowano-drewniana z XIX/XX
- kostnica konstrukcji szachulcowej z 2 poł. XIX
- cmentarz kościelny