Wielka Aleja, nazywa również Aleją Lipową powstała w latach 1768-1770 na miejscu istniejącej od wieków drogi prowadzącej z Gdańska do Oliwy.
Pomysłodawcą jej założenia był pastor Johann Daniel Jenin, który nakłonił do realizacji pomysłu burmistrza gdańskiego Daniela Gralatha i jego żonę Dorothę Juliannę. Z prywatnych funduszy kupiono wtedy 1416 lip holenderskich, które posadzono wzdłuż alei. Część z nich przetrwała do dziś.
W latach 1970-1976 przeprowadzono prace remontowe torowiska i nawierzchni. 21 lipca 1972 r. oddano do użytku nową jezdnię w kierunku Wrzeszcza.