Komorowicki kościół zbudowano w latach 1921-1931 w stylu neogotycko-modernistycznym według projektu Emanuela Rosta juniora. Zastąpił on drewniany kościółek z XVI wieku, który w 1949 r. (w latach 30. i 40. oba stały obok siebie) przeniesiono do Woli Justowskiej (dziś dzielnica Krakowa), gdzie został postawiony na terenie przeznaczonym przez władze wojewódzkie na, nigdy nie utworzone, Muzeum Budownictwa Drewnianego "Skansen" jako eksponat, ale równocześnie kościół parafialny miejscowej parafii; niestety, cenny obiekt nie zachował się do dzisiejszych czasów – spłonął w 2002 r. Pamiątką po nim jest późnogotycki obraz z pocz. XVI wieku przedstawiający Matkę Boską z św. Janem Chrzcicielem i Janem Ewangelistą znajdujący się w ołtarzu głównym.