Pierwotny kościół parafialny zapewne istniał już w XIV wieku. Była to konstrukcja z drzewa dębowego z małym i większym chórem, skierowana na wschód. W 1598 roku obiekt został odremontowany. Nową wieżę przystawiono w 1782 r. W bramie kościoła stała dzwonnica obita tarcicami. Głównym patronem parafii był wtedy św. Jan Chrzciciel. Kroniki podają, że świątynia nie była specjalnie zadbana.
Zmiany nastąpiły dopiero wraz z przybyciem nowego proboszcza. Jego staraniem, w roku 1880 wybudowano obecną świątynię p.w Imienia Najświętszej Maryi Panny, która została konsekrowana siedem lat później.
W 2005 r. , ze względu na kult, jakim cieszy się wizerunek Matki Bożej, ówczesny ordynariusz Archideicezji Gnieźnieńskiej Abp Hneryk Muszyński ustanowił tutaj Sanktuarium Matki Bożej Złotkowskiej.