Jedna z wielu parafii powstałych na ziemi pszczyńskiej w okresie proboszczowania w kościele (macierzystym) Wszystkich Św. w Pszczynie księdza prałata Józefa Kuczery, "budowniczego kościołów".
Potrzeba powstania kościoła w Czarkowie zrodziła się jeszcze przed II wojną światową, w latach 20-tych i 30-tych XX w. Po II wojnie światowej zawiązał się Komitet Organizacyjny założenia kościoła filialnego przy macierzystym kościele Wszystkich Świętych w Pszczynie, dzięki którego staraniom udało się pozyskać i zaadoptować na cele kościelne budynek starej restauracji w Czarkowie. Otwarcie kościoła (wtedy jeszcze filialnego) miało miejsce 17 lutego 1957 r. Adaptacji pomieszczeń na cele kościelne dokonano zgodnie z projektem architekta pana Bryla z Pszczyny. Poświęcenia kaplicy , a następnie kościoła dokonał biskup Herbert Bednorz. Oficjalne uznanie kościoła przez władze państwowe i utworzenie odrębnej parafii nastąpiło dopiero w marcu 1978 r. Erygowanie parafii pod wezwaniem Św. Józefa Robotnika miało miejsce w dniu 23 kwietnia 1978 r. W kolejnych latach do kościoła dobudowano salki, garaże, dom gospodarczy, oraz wybudowano w kościele chór z organami. Obecnie trwają prace projektowo-koncepcyjne nad przebudową kościoła.