Kaplica św. Tomasza z Canterbury (Tomasza Becketa) wybudowana została w latach 1288–1293 na miejscu starszej świątyni. Budowa nowej, gotyckiej kaplicy wiąże się z fundacją przez biskupa wrocławskiego Tomasza II kapituły na zamku w Raciborzu. Biskup zmuszony przez księcia wrocławskiego Henryka IV Probusa do ucieczki schronił się na raciborskim grodzie. Wieloletni spór zakończył się ugodą zawartą w 1287 roku w ówczesnej podraciborskiej miejscowości, a obecnie dzielnicy miasta - Starej Wsi. Wówczas to książę zobowiązał się ufundować kolegiatę św. Krzyża na Ostrowiu Tumskim we Wrocławiu, a biskup - kolegiatę w Raciborzu.
Gotycka kaplica mieści się we wschodnim skrzydle zamku, nieopodal budynku bramnego. Pierwotnie była to budowla dwukondygnacyjna, jednak po pożarze zamku w 1519 roku zlikwidowano podział na część górną i dolną. W roku 1416 kolegiatę przeniesiono do kościoła farnego i z tą chwilą stan kaplicy zaczął się pogarszać. Na przestrzeni wieków kaplica ulegała wielokrotnie pożarom. Po spaleniu w 1637 roku budowlę skrócono o połowę przęsła zachodniego. W XIX wieku nastąpiła regotyzacja kaplicy, dobudowano neogotycką sygnaturkę i portal wejściowy. W takim stanie bryła kaplicy przetrwała do czasów obecnych.
Ze względu na doskonałe proporcję wnętrza obiekt nazywany jest "perłą śląskiego gotyku", lub w nawiązaniu do paryskiej kaplicy królewskiej - "śląska Sainte Chapelle".
Obecnie kaplica czeka na swoje lepsze czasy. W ostatnich latach wyremontowane dach i ściany zewnętrzne, jednak środek cały czas czeka na gruntowną restaurację.