Dom Gotycki, zwany inaczej Kanonicznym, został wybudowany na przełomie XV i XVI w. Do końca XVIII w. pozostawał własnością Kolegiaty św. Małgorzaty. Po kasacie majątku zakonnego został sprzedany na pocz. XIX w. Po zakończeniu II wojny światowej przejął go skarb państwa, a w latach 1959-1965 przeszedł gruntowną renowację. Od tego czasu pozostawał siedzibą Muzeum Okręgowego w Nowym Sączu. 

Obiekt wykonany jako jednopiętrowy, z łamanego kamienia, z częściowym podpiwniczeniem, z dachem czterospadowym. Fronton z dwoma gotyckimi portalami. skierowany w stronę ulicy Lwowskiej.

Od 1975 (reformy administracyjnej kraju) Dom Gotycki był siedzibą  Muzeum Okręgowego w Nowym Sączu, do 2018, kiedy to stał filią Muzeum. Główną siedzibą Muzeum Okręgowego w Nowym Sączu był wówczas gmach przy Jagiellońskiej 56 – były bank, kupiony na potrzeby muzeum dwa lata wcześniej ze środków Województwa Małopolskiego, któremu podlega placówka.

W 1993 Dom Gotycki wrócił na własność parafii św. Małgorzaty, która za symboliczną złotówkę pozostawiła go w dyspozycji placówki na 30 lat – ta umowa dobiegła końca, w związku z czym od 1 listopada 2023 muzem zakończyło działalność w tym miejscu.

Zbiory i biura Muzeum mieszczące się do tej pory przy Lwowskiej mają zostać przeniesione tuż obok Gmachu Głównego, na Jagiellońską 45, do budynku przekazanego przez samorząd województwa.