Wieś należąca do Mierzei Wiślanej w terytorium miasta Gdańska, założona w drugiej połowie XVI w.

W latach 1920–1939 przez osadę przebiegała granica między Niemcami a Wolnym Miastem Gdańsk. Podczas II wojny światowej na terenie miejscowości znajdował się podobóz (Pröbbernau) niemieckiego obozu koncentracyjnego Stutthof. Jego więźniowie w latach 1939–1945 zbudowali obok miejscowości Podler Przebrno wał chroniący mierzeję przed powodziami sztormowymi na zalewie.

W 1948  wprowadzono urzędowo polską nazwę Przebrno w miejsce niemieckiej Pröbbernau.