Nie zachowały się niestety dokumenty założycielskie Ogrodu, a przekazy ustne są w sprzeczności z informacjami z nielicznych zachowanych przedwojennych dokumentów. Przyjmuje się jednak, że III Ogród Jordanowski założono w 1928, na terenie przekazanym władzom miasta przez fundację przemysłowca Wilhelma Ellisa Raua, znanego XIX-wiecznego filantropa i fundatora warszawskich ogrodów dla dzieci.
Po wojnie ogród kontynuował działalność oświatową głównie dzięki ogromnemu zaangażowaniu społeczników i kadry. Od 1 września 1945 roku uruchomiono regularne zajęcia pozaszkolne oraz stołówkę.
Po 1989 kontynuuje swoją działalność w ramach nauczania pozaszkolnego, ale jego charakter i styl pracy uległ zmianie. Ogród zyskał nowoczesne boiska, szatnie, mieszczące się w kontenerach, zewnętrzne toalety. Urządzono też nowoczesny plac zabaw. Całość jest finansowaną z budżetu Miasta Stołecznego Warszawy.